短串联重复序列是目前进行亲子鉴定应用较广泛的遗传标记，基于多色荧光复合扩增和毛细管电泳的STR分型技术简便准确，已实现标准化。这是目前较为常见的一种孕期亲子鉴定方法，也开始逐渐被广泛的应用。那么，孕期亲子鉴定的基本方法有哪些？
1、样本采集
孕期亲子鉴定在毛细管电泳中，正常样本STR分型是将样本的扩增产物与同时电泳的标准等位基因阶梯（Ladder）在相同荧光染料中比对片段大小，并对应到相应基因座的Ladder范围，以及其峰面积和峰高确定分型。但随着DNA检测样本数量与基因座数目的增加，检测中不能准确确定的等位基因分型也相应增多，而无法使用已知的等位基因标准品进行标记。成都孕期亲子鉴定首先要完成样本采集这一环节。
2、样本比对
孕期亲子鉴定也需要注重进行样本比对。在完成样本采集环节之后，就需要对出现OL的基因座或者OL相邻的基因座进行测序。OL为稀有等位基因时，虽然确定稀有等位基因的有助于增加亲缘关系的判断，但此时应妥善使用稀有等位基因的频率数据。这也在一定程度影响了孕期亲子鉴定准确率。
3、样本处理
孕期亲子鉴定需要对被检测的样本进行一定的处理。如若孩子的口腔拭子、带毛囊毛发及指甲样本的检验结果与血样相同，表现为两个个体的混合分型。因此分析该孩子可能是四配子异源嵌合体，体内含有两种细胞系。在检测完，也需要及时的对孕期亲子鉴定的被测样本进行处理。
孕期亲子鉴定由于不同试剂盒基因座设置的顺序、引物序列、Ladder、Bin设计等存在差异，因此可以更换其他试剂盒进行质量保证的复核。从一定意义上来说，未来孕期亲子鉴定这一业务也将得到越来越广泛的应用，极大的便捷我们的生活。
